Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms