Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms