Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubd1Q9R1K7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms