Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htra1Q9R118 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra1Q9R118 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms