Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms