Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms