Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Plod2Q9R0B9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms