Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms