Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a3Q9QZS0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms