Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas3Q9QZQ0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms