Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmlQ9QZD5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.4 ms