Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nphp1Q9QY53 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms