Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Kcnip3Q9QXT8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Kcnip3Q9QXT8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Kcnip3Q9QXT8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Kcnip3Q9QXT8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Kcnip3Q9QXT8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Kcnip3Q9QXT8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Kcnip3Q9QXT8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Kcnip3Q9QXT8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Kcnip3Q9QXT8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Kcnip3Q9QXT8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Kcnip3Q9QXT8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Kcnip3Q9QXT8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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