Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms