Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid2Q9QUS6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms