Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms