Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vstm2bQ9JME9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms