Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms