Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms