Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms