Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms