Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms