Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3bQ9JHJ5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms