Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf3Q9ET30 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf3Q9ET30 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf3Q9ET30 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf3Q9ET30 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf3Q9ET30 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf3Q9ET30 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf3Q9ET30 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf3Q9ET30 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf3Q9ET30 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf3Q9ET30 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm9sf3Q9ET30 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf3Q9ET30 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms