Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trhr2Q9ERT2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms