Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms