Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Slco1c1Q9ERB5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms