Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms