Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pold3Q9EQ28 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pold3Q9EQ28 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pold3Q9EQ28 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pold3Q9EQ28 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms