Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms