Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop7Q9DCH2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms