Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde1Q9DBZ9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms