Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms