Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms