Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8Q6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Q9D8Q6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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