Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cldn22Q9D7U6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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