Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7P7

Clic3, Chloride intracellular channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic3Q9D7P7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Clic3Q9D7P7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Clic3Q9D7P7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Clic3Q9D7P7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic3Q9D7P7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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