Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms