Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D454 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D454 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D454 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D454 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D454 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D454 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D454 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D454 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D454 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D454 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D454 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D454 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D454 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D454 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D454 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D454 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D454 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D454 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D454 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D454 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D454 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D454 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D454 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D454 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D454 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D454 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D454 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D454 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D454 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D454 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D454 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D454 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D454 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D454 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D454 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D454 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms