Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms