Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms