Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chchd2Q9D1L0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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