Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms