Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tspan11Q9D1D1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms