Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms