Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms