Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms