Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc18Q9CZJ9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc18Q9CZJ9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms