Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nde1Q9CZA6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms