Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms